Em São Francisco do Conde e todo o território nacional, a Campanha de Vacinação Contra a Influenza começou dia 23 de abril e segue até 01° de junho. Nesta campanha, além de indivíduos com 60 anos ou mais, serão vacinadas crianças na faixa etária de seis meses a menores de cinco anos de idade (04 anos, 11 meses e 29 dias), gestantes, puérperas (mulheres até 45 dias após o parto), trabalhadores da saúde, professores das escolas públicas e privadas e portadores de doenças crônicas não transmissíveis, além de outras condições clínicas especiais.
No município, a cobertura para indivíduos com 60 anos ou mais já atingiu a meta esperada. Porém, os números de crianças e gestantes que ainda não se protegeram preocupam as equipes de saúde do município.